菌種凍干機是一款專門針對菌種保存而設計的凍干機。利用安剖管架預凍好的樣品直接轉移擺放到凍干倉隔板上即可，容量大，操作簡便。316L醫用級不銹鋼材質方形凍干倉，隔熱保溫效果好，真空性能好，有效避免樣品因干燥過程中升溫過快而發生樣品外形塌陷，活性降低等問題。是研究菌種保存客戶的理想選擇。
冷凍干燥是將菌體懸浮液冷凍到冰點以下，從而轉變為固體結晶態，然后在低溫低壓(真空)下使固體升華而脫水的干燥方法。一般干燥處理過程會破壞微生物的細胞膜，引起細胞的大量死亡，因此需要添加保護劑，能夠使菌液密度均一，減少活菌在凍干過程中的機械效應和溶質效應帶來的死亡。因此，在凍干前加入的保護劑配方就成為了至關重要的決定性因素，它既會影響到儲存期細胞的活性以及穩定性，也會影響到復水時細胞存活率。
菌種凍干機保存菌種的步驟主要包括：
1、微生物培養，培養獲得健壯的菌種擴培液體。培養時根據菌種選擇不同的培養基。培養到對數期獲得大量健壯的菌種，保證菌體濃度，一般達到109的濃度.
2、離心收集菌體。通過離心法從液體培養基中獲得菌體。如果是固體培養基可以直接收集菌落，用保護劑溶解混勻。
3、將菌體、脫脂奶粉、海藻糖、蔗糖等保護劑在無菌水中混勻得到含有保護劑的菌體混懸液。
4、分裝。將菌體混懸液在無菌環境中分裝到無菌容器中，可以是安瓿瓶、西林瓶、EP、培養皿等。
5、預凍，預凍是非常關鍵的。預凍不好，菌體會死亡。要快速預凍，防止產生大冰晶造成細胞死亡。預凍要凍結實，保證預凍充分。
6、將預凍好的菌體，放入真空冷凍干燥設備中進行凍干。如果是設備帶預凍功能，也可以直接在凍干機上進行預凍。真空冷凍干燥時間和凍干曲線的設計要根據菌種的不同和菌體混懸液的濃度等進行設計。凍干好后真空密封保存。
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